Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Casq1O09165 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casq1O09165 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casq1O09165 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq1O09165 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq1O09165 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Casq1O09165 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casq1O09165 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Casq1O09165 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casq1O09165 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Casq1O09165 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.7 ms