Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm2035J3QP87 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2035J3QP87 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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