Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav14-2A0A075B694 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-2A0A075B694 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav14-2A0A075B694 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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