Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ8

KRTAP4-9, Keratin-associated protein 4-9, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 LSMEM1-202ENST00000439068 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC011005.1-201ENST00000467614 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 THOC7-204ENST00000469584 836 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC109588.1-202ENST00000515720 880 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC022695.2-201ENST00000518042 768 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 CETN3-204ENST00000522565 867 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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KRTAP4-9Q9BYQ8 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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KRTAP4-9Q9BYQ8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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KRTAP4-9Q9BYQ8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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KRTAP4-9Q9BYQ8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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KRTAP4-9Q9BYQ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC136285.1-201ENST00000566092 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 PATE3-201ENST00000445202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP4-9Q9BYQ8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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