Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms