Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEIL2Q969S2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms