Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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