Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HECW1Q76N89 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms