Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q6P435 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q6P435 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q6P435 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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