Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MSMPQ1L6U9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms