Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD2Q16342 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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