Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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