Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSRP1Q08945 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms