Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms