Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2BQ00403 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms