Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms