Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CHRNA7P36544 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms