Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms