Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA1P22314 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA1P22314 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms