Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18529 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18529 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18529 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18529 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18529 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18529 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18529 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18529 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18529 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18529 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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