Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DMDP11532 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DMDP11532 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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