Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms