Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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