Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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