Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms