Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT2Q8N9I0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT2Q8N9I0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms