Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mtmr3Q8K296 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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