Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms