Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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