Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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