Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms