Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P63132 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms