Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCAP28676 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms