Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD8P13378 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD8P13378 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms