Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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