Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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C4orf47A7E2U8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf47A7E2U8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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