Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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