Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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