Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYTH4Q9UIA0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms