Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VPS29Q9UBQ0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms