Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LHX5Q9H2C1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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