Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmed11Q9D2R4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmed11Q9D2R4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms