Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms