Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms