Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms