Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms