Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms