Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNA1Q09470 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms