Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CFHR1Q03591 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms