Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN7AQ01118 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms